壓力不穩是液相色譜脫氣機zui為常見的故障，其表現為壓力在一段時間逐漸變化和壓力瞬間變化。總結原因不外乎以下四種情況：
　　1、有氣泡
　　一般是在開機的一段時間內出現，往往是流動相在液相色譜脫氣機色譜柱內還沒有平衡好、柱箱溫度還沒有恒定。這些都不屬于儀器問題，只要多平衡一會就會穩定。若使用的是梯度程序，由于流動相的比例正處在變化中，壓力也會跟隨變化。
　　2、漏液
　　首先排除氣泡因素：氣泡的產生是由于流動相中溶解了空氣，在泵壓的作用下空氣會分離出來，氣泡留在泵體內排不出去，它不僅影響到流量的準確，泵壓也會不穩，這時我們只要打開排廢閥，利用快速沖洗功能很快就能將氣泡趕出。為防止氣泡產生，的辦法就是使用在線脫氣裝置。
　　如果使用中我們發現，連接過濾頭的輸液管中有微小的氣泡流動時，這說明液相色譜脫氣機過濾頭有堵塞現象必須清洗，你可用10％的硝酸進行超聲15分鐘，如果還有氣泡產生那就該換新濾頭了。
　　3、單向閥不良
　　當有鹽份或者雜質等污染物附著在單向閥內球體和閥體表面時，就會破壞密封性，造成輸液的單向性能降低，泵雖然在工作，但就是輸送不好液體，嚴重時不能輸液。反映到壓力上，表現為嚴重不穩或沒有壓力。這時你可以卸下單向閥，用異丙醇超聲清洗20分鐘。如果有鹽份，再用熱水超聲清洗一遍效果會更好。若清洗后還達不到要求，可將單向閥再接到流路上用大流量異丙醇沖洗。單向閥的結構比較精細，如果沒有把握先不要分解清洗，用超聲波清洗時要注意擺放的位置防止部件震散，否則裝配后效果會不理想。當單向閥內的球體損傷時就只有更換了。
　　4、泵工作相位不正確
　　這種情況發生的比較少，可以通過調節泵的初始位置解決。